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आणविक माइक्रोबायोलॉजी और माइक्रोबियल जीनोमिक्स प्रयोगशाला

मानव आंत में रहने वाली सूक्ष्मजीव कोशिकाएं हमारे शरीर में कुल मानव कोशिकाओं की संख्या से अधिक होती हैं। हम नियमित रूप से पर्यावरण से कई रोगाणुओं के संपर्क में आते हैं। इसलिए उन रोगाणुओं के जीव विज्ञान को समझना आवश्यक है जो हमारे लिए फायदेमंद हो सकते हैं और साथ ही वे जो संभावित रूप से हानिकारक हैं। आणविक तरीकों का उपयोग करके हम व्यक्तिगत सूक्ष्मजीव कोशिकाओं के साथ-साथ सूक्ष्मजीव समुदायों की बुनियादी कार्यप्रणाली को समझने का प्रयास करते हैं। सूक्ष्मजीव अक्सर तनावपूर्ण परिस्थितियों में बायोफिल्म बनाकर विकास के सामुदायिक मोड में चले जाते हैं। बायोफिल्म पॉलीमाइक्रोबियल हो सकते हैं और उन्हें खत्म करना मुश्किल होता है क्योंकि वे उन तनावों के प्रति प्रतिरोधी होते हैं जिनके प्रति व्यक्तिगत बैक्टीरिया संवेदनशील होते हैं। इस विषय के तहत काम कर रहे शोधकर्ताओं का एक छोटा समूह व्यक्तिगत रोगाणुओं के साथ-साथ उनके समुदायों की फिजियोलॉजी को समझने के लिए आणविक तरीकों और जीनोमिक्स दृष्टिकोण का उपयोग करता है।


प्रयोगशाला से जुड़े संकाय सदस्य

शंकर मनोहरण

सहेयक प्रोफेसर
email shankarmanoharan@iitj.ac.in
call (91 291) 280 1209

नेहा जैन

सहायक प्रोफेसर
email njain@iitj.ac.in
call (91 291) 280 1210

इस विषय के अंतर्गत समूह

1. माइक्रोबियल फिजियोलॉजी समूह

 

माइक्रोबियल फिजियोलॉजी प्रयोगशाला (एमपीएल) के दो प्रमुख फोकस क्षेत्र हैं:

1. अस्पताल से जुड़े रोगजनकों में विषाणु विनियमन

हम अध्ययन करते हैं कि सूक्ष्मजीव किस तरह से उन महत्वपूर्ण कारकों के उत्पादन को नियंत्रित करते हैं जो किसी मेज़बान में बीमारी पैदा करने के लिए ज़रूरी हैं।

2. चिकित्सकीय रूप से प्रासंगिक सूक्ष्मजीव समुदाय

हम स्वास्थ्य और रोगग्रस्त अवस्थाओं के संदर्भ में मानव आंत माइक्रोबायोटा का पता लगाते हैं ताकि बेहतर शारीरिक स्थिति में योगदान देने वाले पैटर्न की पहचान की जा सके

2. बायोफिल्म्स और एमिलॉयड बायोलॉजी समूह

हम एक विशिष्ट समूह हैं जिसकी रुचियाँ विविध लेकिन एक दूसरे से मिलती-जुलती हैं। प्रयोगशाला में शोध प्रोटीन के बदले हुए तह के इर्द-गिर्द घूमता है जिससे एमिलॉयड नामक व्यवस्थित समुच्चय बनते हैं। हम यह समझने में रुचि रखते हैं कि बैक्टीरिया एमिलॉयड मनुष्यों में बायोफिल्म निर्माण और गंभीर संक्रमण में कैसे योगदान करते हैं। हम विभिन्न पर्यावरणीय परिस्थितियों में बैक्टीरिया द्वारा एमिलॉयड-निर्भर बायोफिल्म के निर्माण और अवरोध के तंत्र को स्पष्ट करने के लिए बायोफिजिकल तकनीकों के संयोजन का उपयोग करते हैं। वर्तमान में, हमारी प्रायोगिक योजना इन विट्रो अध्ययनों तक सीमित है, हालांकि भविष्य में हम सेल कल्चर और पशु आधारित मॉडल में अध्ययन का विस्तार करेंगे। समूह बैक्टीरियल एमिलॉयड के निम्नलिखित पहलुओं में रुचि रखता है, लेकिन इन्हीं तक सीमित नहीं है:

1. माइक्रोबियल एमिलॉयड के गठन और बायोफिल्म संक्रमण में उनकी भूमिका को समझना।

2. एमिलॉयड-व्युत्पन्न बायोफिल्म गठन से निपटने के लिए रणनीतियों का विकास।




प्रयोगशाला द्वारा वर्तमान में जिन परियोजनाओं पर काम किया जा रहा है

 

1. बायोफिल्म संक्रमणों से निपटने के लिए मेजबान प्रोटीन का कार्यान्वयन (डॉ. नेहा जैन)

एस्चेरिचिया कोली और संबंधित एंटरिक बैक्टीरिया बायोफिल्म नामक समुदाय बनाते हैं जो मेजबान प्रतिरक्षा सुरक्षा और एंटीबायोटिक उपचार के प्रति प्रतिरोधी होते हैं। इसलिए, बायोफिल्म से संबंधित संक्रमणों के इलाज के लिए पारंपरिक एंटीबायोटिक थेरेपी के वैकल्पिक तरीकों की तत्काल आवश्यकता है। बायोफिल्म मैट्रिक्स एक्सोपॉलीसेकेराइड, बाह्यकोशिकीय डीएनए और प्रोटीन पॉलिमर से बना होता है जिसे आम तौर पर एमिलॉयड फाइब्रिल के रूप में जाना जाता है। कर्ली ई. कोली में उत्पादित एमिलॉयड फाइब्रिल हैं। कर्ली की प्रमुख सबयूनिट CsgA प्रोटीन है जो इन विट्रो स्थितियों के तहत एमिलॉयड फाइब्रिल बनाने में सक्षम है। बायोफिल्म निर्माण को रोकने के लिए एक अभिनव रणनीति कोशिका की सतह पर एमिलॉयड एकत्रीकरण को रोकना है। हम चैपरोन जैसे प्रोटीन की पहचान करने और उनकी विशेषता बताने में अपना प्रयास कर रहे हैं जो एमिलॉयड और बायोफिल्म निर्माण को रोक सकते हैं।

 

2. मानव चैपरोन जैसे प्रोटीन का उपयोग करके α-सिन्यूक्लिन एमिलॉयड असेंबली का मॉड्यूलेशन (डॉ. नेहा जैन)

अधिकांश मानव प्रोटीन आनुवंशिक या पर्यावरणीय उत्तेजनाओं की प्रतिक्रिया में शायद ही कभी लेकिन उल्लेखनीय रूप से स्वतःस्फूर्त संरचनागत परिवर्तन से गुजरते हैं। α-सिन्यूक्लिन एक ऐसा प्रोटीन है जो संरचनागत स्विच से गुजरता है जिसके परिणामस्वरूप एमिलॉयड का निर्माण होता है जो पार्किंसंस रोग (पीडी) की प्रगति से जुड़ा हुआ है। α-सिन्यूक्लिन एकत्रीकरण और पीडी प्रगति पर शोध की वर्तमान स्थिति से पता चलता है कि पारंपरिक चिकित्सा लंबे समय में रोग को ठीक करने में काम नहीं कर सकती है। नए चिकित्सीय हस्तक्षेपों की सख्त जरूरत है जो पीडी को रोक सकें या प्रगति के शुरुआती चरण में इसे दबा सकें। α-सिन्यूक्लिन एमिलॉयड असेंबली को दरकिनार करने में जन्मजात चैपरोन जैसे प्रोटीन की भूमिका और भविष्य की दवाओं के रूप में उनकी क्षमता अभी भी अपनी प्रारंभिक अवस्था में है। यहां, हम सिन्यूक्लिन एकत्रीकरण के खिलाफ चैपरोन जैसे प्रोटीन की एंटी-एमिलॉयड गतिविधि का पता लगाने की योजना बना रहे हैं।

 

3. अस्पताल से जुड़े ESKAPE रोगजनक: विषाणु और दृढ़ता को नियंत्रित करने वाली नई विनियामक परतों को उजागर करना (डॉ. शंकर मनोहरन)

अस्पताल से जुड़े संक्रमणों से पीड़ित मरीज श्वसन पथ, मूत्र पथ, रक्त प्रवाह, कोमल ऊतकों आदि के संक्रमण से पीड़ित होते हैं। एक स्मार्ट कदम में, अस्पताल से जुड़े रोगजनक तेजी से विभिन्न एंटीबायोटिक दवाओं के प्रति प्रतिरोध प्राप्त कर रहे हैं जो नियमित रूप से चिकित्सा में उपयोग किए जाते हैं। इसका मतलब है कि इन जीवाणुओं के कारण होने वाले संक्रमणों का इलाज करना मुश्किल होता जा रहा है।

ही वह जगह है जहाँ हम तस्वीर में आते हैं। हम इस समस्या से निपटने के लिए दो-आयामी दृष्टिकोण अपनाते हैं:

1. अस्पताल से जुड़े रोगजनकों में विषाणु को नियंत्रित करने वाली जटिल विनियामक प्रक्रियाओं का अध्ययन करें ताकि हम जिस दुश्मन से लड़ रहे हैं उसके बारे में अपने ज्ञान का विस्तार कर सकें

2. अस्पताल से जुड़े रोगजनकों के विषाणु कारकों का अध्ययन करें ताकि यह आकलन किया जा सके कि क्या वे रोगजनक की विषाणुता को प्रभावित करने के लिए प्रभावित हो सकते हैं

 

4. विषाणु क्लेबसिएला न्यूमोनिया द्वारा कैप्सूल संश्लेषण पर चयनित अणुओं के प्रभाव का मूल्यांकन (डॉ. शंकर मनोहरन)

क्लेबसिएला न्यूमोनिया एक अस्पताल से जुड़ा रोगज़नक़ है जो तेजी से नोसोकोमियल संक्रमण का कारण बन रहा है। रहस्यमय क्लेबसिएला कैप्सूल कई मेजबान बचावों से सूक्ष्मजीव की रक्षा करने वाले प्रमुख विषाणु कारकों में से एक है। हम क्लेबसिएला न्यूमोनिया द्वारा कैप्सूलर पॉलीसैकेराइड के संश्लेषण पर चयनित अणुओं के संभावित निरोधात्मक प्रभावों का अध्ययन करते हैं

उपलब्ध मुख्य उपकरण

 
AKTA प्रोटीन शुद्धिकरण प्रणाली
प्रोब सोनिकेटर
मल्टी-मोड प्लेट रीडर
माइक्रोवॉल्यूम फ्लोरोमीटर
ब्लॉटिंग उपकरण के साथ इलेक्ट्रोफोरेसिस सिस्टम
हाइब्रिडाइजेशन ओवन
माइक्रोप्लेट रीडर
प्रयोगशाला कार्य केंद्र
बैक्टीरियोलॉजिकल इनक्यूबेटर
इनक्यूबेटर शेकर
रेफ्रिजरेटेड सेंट्रीफ्यूज
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